Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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