Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad54bQ6PFE3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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