Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scaf8Q6DID3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms