Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp11bQ6DFW5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms