Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pdzrn3Q69ZS0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms