Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PatjQ63ZW7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms