Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ift52Q62559 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ift52Q62559 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms