Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtmQ62388 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
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AtmQ62388 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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AtmQ62388 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtmQ62388 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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