Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ss18Q62280 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ss18Q62280 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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