Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ecm1Q61508 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ecm1Q61508 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ecm1Q61508 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ecm1Q61508 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ecm1Q61508 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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