Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd1Q61466 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smarcd1Q61466 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms