Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usf1Q61069 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usf1Q61069 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms