Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Myh1Q5SX40 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms