Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spag9Q58A65 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms