Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2Q3V1H1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms