Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn13Q3UW68 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms