Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms