Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms