Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem253Q3UNB8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem253Q3UNB8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms