Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nkx6-3Q3UHX8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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