Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms