Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U6N9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U6N9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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