Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otud5Q3U2S4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms