Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KhsrpQ3U0V1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms