Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms