Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Prr27Q3SYJ2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms