Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim71Q1PSW8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms