Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Rpusd3Q14AI6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpusd3Q14AI6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.7 ms