Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cntnap5cQ0V8T7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms