Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neurl1bQ0MW30 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms