Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms