Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pate4Q09098 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms