Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Calb2Q08331 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Calb2Q08331 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms