Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MestQ07646 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
MestQ07646 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MestQ07646 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MestQ07646 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms