Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms