Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Siah1bQ06985 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms