Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms