Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnb1Q03717 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms