Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb5Q02739 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms