Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GscQ02591 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GscQ02591 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms