Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gbp1Q01514 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms