Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top2aQ01320 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms