Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin2bQ01097 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin2bQ01097 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms