Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SeleQ00690 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms