Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GabpaQ00422 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms