Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gbp10Q000W5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms