Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lig3P97386 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms