Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme1P97371 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms