Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf1bP97358 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf1bP97358 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms