Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb2P81069 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms